Un jeune élève a joué un rôle crucial dans la découverte de l’Orfamide N, une molécule prometteuse aux propriétés anti-cancers, détectée dans les excréments d’une oie dans le cadre d’un projet de recherche. Cette avancée pourrait potentiellement conduire à des traitements novateurs contre certaines tumeurs malignes.
Un élève de collège a contribué de manière fondamentale à la découverte de l’Orfamide N, une nouvelle molécule avec de fortes capacités anti-cancer contre les cellules des tumeurs malignes. Le composé a été détecté dans les excréments d’une oie, que le jeune avait collectés pour un projet de recherche spécifique. Que savons-nous de l’Orfamide N et qu’indique-t-il qu’il soit cytotoxique contre les lignées mobiles tumorales humaines.
Début décembre 2024, la découverte d’un nouveau composé anti-cancer dans les fèces d’une oie a fait la une des journaux internationaux, grâce à la contribution essentielle d’un collégien. L’élève, avec ses camarades du groupe “Boys and Girls Clubs of Chicago” (BGCC), participait au projet de recherche “Chicago Antibiotic Discovery Lab” dirigé par les scientifiques du Centre pour les Sciences Biomoléculaires de l’Université de l’Illinois. En termes simples, les jeunes ont participé à une sorte de chasse aux nouvelles molécules, à identifier au sein de prélevés biologiques collectés dans l’environnement naturel. L’élève a décidé de se pencher sur les excréments de l’oiseau et, c’est à partir des analyses réalisées sur ceux-ci, que l’Orfamide N a été identifié. Il s’agit d’un lipodépsipeptide cyclique totalement nouveau avec des propriétés cytotoxiques contre les cellules tumorales, en particulier contre celles du cancer de la peau (mélanome) et du cancer des ovaires (carcinome ovarien), comme le montre l’étude publiée dans la revue scientifique à comité de lecture ACS Omega. L’objectif initial était de révéler de nouveaux composés avec des capacités antibiotiques, mais il semblerait qu’un élément beaucoup plus précieux ait été identifié.
Les jeunes, sous la supervision étroite du professeur Brian T. Murphy et de ses collègues de l’université de Chicago, avaient été formés à utiliser des dispositifs robotisés pour isoler les colonies bactériennes au sein des échantillons biologiques prélevés et évaluer les propriétés des composés isolés. “Le processus utilise un robot de prélèvement de colonies à haut débit enfermé dans une enceinte de sécurité biologique de niveau 2, permettant aux étudiants d’exécuter en toute sécurité divers processus initiaux tels que la croissance bactérienne, la sélection des colonies et le transfert de bactéries dans des plaques de bioanalyse multipozzetto”, est-il précisé dans l’abstract de l’étude.
Dans les excréments de l’oie, collectés au niveau du Garfield Park Lagoon (la species n’a pas été spécifiée), une colonie bactérienne de Pseudomonas idahonensis a été isolée. Dans les produits de ces microorganismes, à travers des analyses spécifiques – comme la chromatographie liquide à ultra haute performance-spectrométrie de masse tandem (UPLC-MS/MS) – les scientifiques ont identifié trois lipodépsipeptides cycliques, dont deux déjà connus (Orfamide M et Orfamide A) et un tout nouveau, qui a été nommé par les chercheurs Orfamide N. Cela constitue une classe de composés particulièrement significative, comme le montre la littérature scientifique.
L’Orfamide A, ayant une valeur de plus de 1 100 dollars pour seulement 5 milligrammes, avait déjà été obtenu à partir de la bactérie Pseudomonas fluorescens; le composé présente de fortes propriétés antifongiques et est capable de détruire les zoospores du champignon Phytophthora ramorum, responsable de la mort subite des chênes. L’Orfamide M et d’autres orfamides – comme le B – ont également montré la capacité de percer les membranes mobiles de divers agents pathogènes, en particulier ceux qui attaquent les plantes. Leurs propriétés sont liées à la combinaison de composants lipidiques (graisses) et peptidiques, c’est-à-dire des chaînes d’acides aminés. La structure de l’Orfamide N se caractérise par une chaîne de 10 acides aminés.
Comme le soulignent les auteurs de l’étude, des recherches antérieures ont montré que les lipodépsipeptides cycliques obtenus à partir de bactéries du genre Pseudomonas “possèdent activité antibactérienne et des effets antiprolifératifs sur les lignes mobiles tumorales humaines”. “De plus – expliquent Murphy et ses collègues dans l’abstract de l’étude – divers orfamides ont montré une activité cytotoxique dans les cellules eucaryotes, y compris des activités insecticides, antifongiques et algicides”. À la lumière de toutes ces promesses intéressantes, l’équipe de recherche a décidé d’analyser les propriétés anticancéreuses et antibactériennes de l’Orfamide N.
Eh bien, à travers des tests appropriés, il a été observé qu’à des concentrations de 11,06 et 10,50 μM, le composé se montre cytotoxique contre les cellules du mélanome et du cancer des ovaires lors de tests en laboratoire, c’est-à-dire sur des lignées mobiles en culture. Cela indique qu’il a la capacité de endommager et tuer. Les capacités anticancéreuses notables doivent bien sûr être confirmées par d’autres investigations, mais il est clair qu’il s’agit d’un composé potentiellement très prometteur. Il n’est donc pas étonnant que les scientifiques parlent de “composé naturel de haute qualité”. Et le mérite revient entièrement à un jeune qui a trouvé l’exemplaire adéquat pour parvenir à ce résultat significatif. Pour l’instant, nous ne savons pas si ce composé pourra un jour se transformer en un nouveau médicament anticancer, après avoir surmonté l’intégralité de la longue procédure des tests de pertinence et de sécurité précliniques et, surtout, cliniques (c’est-à-dire sur l’homme). L’ensemble de la recherche pourrait n’engendrer aucun résultat, comme c’est souvent le cas pour de nombreux composés cytotoxiques qui se montrent efficaces dans les essais précliniques; cela n’enlève cependant rien à la valeur scientifique précieuse de cette découverte. Cela revêt également une importance éducative.