Une étude récente met en lumière le rôle crucial des bactéries intestinales bénéfiques dans la protection contre certaines infections. Ces découvertes offrent un aperçu fascinant de nouvelles approches possibles pour lutter contre les bactéries nocives, suggérant des alternatives aux antibiotiques grâce à une alimentation riche en fibres.
De la digestion des fibres, certaines bactéries bénéfiques produisent des acides gras à chaîne courte, des substances qui, en plus de leurs nombreux bienfaits pour notre santé, semblent empêcher la croissance de bactéries nocives. Cette découverte suggère la possibilité de trouver des méthodes alternatives aux antibiotiques dans le traitement des infections.

De plus en plus d’études mettent en avant le rôle fondamental de notre microbiote intestinal, c’est-à-dire l’ensemble des bactéries présentes dans notre intestin, pour notre santé globale, et pas seulement pour le bon fonctionnement du système gastro-intestinal. Aujourd’hui, une nouvelle recherche a révélé que certaines bactéries pourraient même nous protéger contre certaines infections, causées par une souche bactérienne assez fréquente, les Enterobactéries (ou Enterobacteriaceae).
Il s’agit d’une famille de bactéries souvent associées à des infections intestinales, comme les entérites ou les gastro-entérites. La plus courante, l’Escherichia coli, est normalement présente en petites quantités dans notre intestin, mais lorsque sa prolifération dépasse un certain seuil, elle peut devenir problématique, surtout lorsque certains souches plus dangereuses sont présentes, souvent responsables d’infections intestinales et extra-intestinales.
La recherche sur le microbiote intestinal
Ce sont précisément les études sur le microbiote intestinal qui ont permis à un groupe de chercheurs de l’Université de Cambridge de découvrir comment certaines bactéries naturellement présentes dans notre intestin peuvent offrir une action protectrice contre le risque d’infection par les Enterobactéries. Leur étude s’est basée sur l’analyse de plus de 12 000 échantillons de selles de personnes issues de 45 pays, même si certaines régions du monde ont été exclues. À partir de ceux-ci, la composition du microbiote intestinal des participants a été reconstituée grâce à le séquençage de l’ADN : il en est ressorti que les échantillons contenant des Enterobactéries présentaient un microbiote complètement différent de celui où cette souche était absente.
Comment les fibres peuvent réduire le risque de cancer : une étude révèle un mécanisme clé
L’association était si forte qu’à partir de la flore bactérienne d’un individu, il était possible de prédire la présence de cette souche bactérienne avec un degré de certitude de 80%. « Cela nous a montré que les types de bactéries qui peuplent notre intestin – expliquent les chercheurs – sont étroitement liés au risque que des espèces nuisibles puissent prendre le dessus ».
Plus précisément, les chercheurs ont constaté qu’un groupe de bactéries, appelées « co-colonisateurs », étaient presque toujours présentes dans les échantillons avec Enterobactéries, tandis qu’un autre groupe était principalement absent en présence de ces dernières, ce qui les a conduits à les renommer « co-exclusifs ». De l’analyse de ce second groupe, qui semblait donc jouer un rôle antagoniste par rapport aux Enterobactéries, est ressorti le rôle fondamental d’une bactérie déjà connue pour ses effets bénéfiques. Il s’agit du Faecalibacterium, un microbe très commun dans l’intestin des personnes en bonne santé, au point d’être considéré comme un biomarqueur de la santé intestinale.
Les effets des fibres sur les bactéries nuisibles
Les chercheurs de l’université anglaise ont observé comment cette bactérie favorise la production d’acides gras à chaîne courte provenant de la digestion des fibres alimentaires, en particulier les solubles. Parmi les aliments qui en contiennent, on trouve les céréales, comme l’avoine ou l’orge, le riz complet et les son, divers légumineuses, mais aussi de nombreux fruits et légumes.
Ces substances sont essentielles pour l’équilibre du microbiote intestinal et pour la santé de l’ensemble de l’organisme, combattant l’inflammation – une autre étude récente a établi un lien avec la réduction du risque de cancer – et nous savons maintenant qu’elles peuvent aussi empêcher la croissance des bactéries nuisibles souvent associées aux infections.
Cette étude, en plus de confirmer le rôle des acides à chaîne courte et par conséquent l’importance de consommer un riche contenu de végétaux riches en fibres, suggère – soutiennent les chercheurs – la possibilité de découvrir « de nouvelles manières de prévenir et traiter les infections sans antibiotiques« .
« Par exemple, au lieu de tuer directement les bactéries nuisibles (avec le risque de nuire également aux bonnes bactéries), nous pourrions augmenter les co-exclusifs ou créer des régimes qui soutiennent leur croissance« , expliquent les chercheurs. Une donnée particulièrement importante si l’on considère que l’résistance aux antibiotiques représente l’une des urgences sanitaires actuelles les plus alarmantes ; on estime en effet qu’d’ici 2050, les bactéries résistantes aux antibiotiques pourraient causer plus de dix millions de décès par an.
